В статье рассмотрены методологические научные подходы при формировании устойчивого землепользования на интенсивно осваиваемых территориях. Предложена усовершенствованная методология устойчивого землепользования на основе биотической регуляции окружающей среды и иерархии уровней управления устойчивым землепользованием. На основе данной методологии рассмотрены научно-методические принципы устойчивого землепользования: обоснование стратегических приоритетов и индикаторов, комплексная (эколого-экономическая) оценка, определение «коридоров» допустимого землепользования, согласование интересов индивидуальных землепользователей и общественных предпочтений, многокритериальная (междисциплинарная) оптимизация многоцелевого землепользования. Стратегические приоритеты и индикаторы устойчивого землепользования зависят от эколого-экономических и социальных условий и форм землепользования. Эколого-экономическая оценка земельных ресурсов производится на основе натуральных показателей, технологических и технических параметров, экономических эквивалентов и комплексного критерия. Определение «коридоров» допустимого землепользования производится по экологическим, экономическим и социальным параметрам. Индивидуальные интересы землепользователей проявляются на относительно коротких периодах времени, а общественные предпочтения выражаются в постоянном, долговременном землепользовании. Поиск оптимальных вариантов устойчивого землепользования заключается в раскрытии неопределенности оптимальных решений по частным критериям и в многокритериальном решении по обоснованным уступкам.