Охарактеризована процедура автоматического выделения функциональной неоднородности геосистем по данным дистанционного зондирования Земли. Такая неоднородность используется в качестве индикатора геосистемных границ и нарушенности пространственных объектов под воздействием естественных и антропогенных факторов. По результатам обработки снимков оценена нарушенность геосистем в южных районах Прибайкалья.