Почвенно-экологические условия г. Биробиджан характеризуются на основе базовой карты почв и схемы почвенно-экологического зонирования. Структура почвенного покрова города включает естественные не нарушенные, естественные нарушенные, глубокопреобразованные почвы и поверхностные техногенные образования. Почвы с полностью сохраненными экологическими функциями занимают 54 % от всей площади города.